碩士班課程主要在培養學生獨立思考與問題分析解決能力。專業領域包括組織與人力資源管理、行銷與資訊管理、財務管理、作管與供應鏈管理等。此外，本系亦開放碩士班與碩士在職專班學生跨班修課，以促進學生間交流，增加在校同學對實務問題的瞭解。跨班修課也使學生能選修的課程數量多，範圍廣泛。
碩士班於97學年度增設國際商管組，單獨招生，全部課程以英文授課。相關課程及招生資訊請參閱網站：http://www.gbp.scu.edu.tw/
整體課程規劃以及相關課程脈絡如課程地圖所示。(點擊圖片可另開視窗放大檢視)
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